1、综合科：负责市档案馆的综合协调工作，协助市档案馆领导处理日常事务；负责综合性文稿的起草工作；负责文秘、档案、保密、信息、财务、会务、后勤服务保障工作；负责离退休人员的服务、管理工作；负责安全保卫、工会、医疗保健、接待、信访等行政管理工作；完成领导交办的其它事项。

2、党建科（人事科）：负责馆干部人事工作；负责馆内纪检监察工作；负责馆机关党建工作；组织开展学习宣传贯彻党的路线、方针、政策和决定，做好干部职工的政治思想教育工作；做好精神文明创建工作；完成领导交办的其它事项。

3、管理利用科：负责馆藏实体档案资料的保管、统计工作；负责馆藏档案资料的利用和咨询工作；负责市级机关、团体、企事业单位实体档案的进馆接收；负责馆藏档案资料的整理、编目工作；负责实体档案库房的管理和库房安全设备的使用管理；组织实施馆藏实体档案资料的鉴定、开放、销毁工作；设置政府信息查阅场所，向社会提供公开的政府信息查阅服务；完成领导交办的其它事项。

4、信息技术科：负责馆档案信息化工作；负责本馆信息化设施设备、信息系统、网络的配置和运维管理、安全保障工作；承担市级电子档案和档案数字化成果的接收、保管工作；承担馆藏档案数字化和重要电子档案异地异质备份工作；开展档案信息保护技术研究和应用等科研工作；完成领导交办的其它事项。

5、编研征集科：负责编写档案参考资料，出版档案史料，进行历史研究；参与有关史志的编修工作；承办档案展览；发布档案信息；负责散存在社会上有重要价值档案资料的征集工作；完成领导交办的其它事项。

6、交流服务科：负责市档案馆的馆际交流工作；负责市直机关、企事业单位及社会团体和公民的档案业务咨询服务；负责文创产品研发和市场开拓工作；负责档案专业人员相关教育培训工作；负责档案馆宣传工作和二级馆运转保障工作；完成领导交办的其它事项。